化學制藥的生產過程，由原料藥生產和藥物制劑產組成，通過化學合成工藝和藥用植物中分離提純得到原料藥。生產過程具有的特點是：物料凈收率低，副產品多，三廢多，尤其是廢水處理難度大。化學制藥企業在工業生產中產生的廢水具有有機物及無機鹽含量高，BOD5和CODcr 比值低且波動大，可生化性很差，間歇排放，水量波動大等特點。

制藥廢水處理中對于中藥廢水的處理可以單獨采用物化處理技術就能完成，也可以與生物處理技術相結合來完成。采用的物理化學法有：物理吸附法、浮選物化法、化學混凝法膜析法以及濕式氧化物化法、生物處理法、化學處理技術等七種。

1、吸附法在多孔性的固體作用下使得污水中的一種或幾種組分得到吸附從而使污水無害化的一種處理方法。粉煤灰廉價吸附材料可適用于生物法的預處理，粉末活性炭適用于深度處理，經吸附法處理后，廢水中COD和色度的去除率可以分別達到40%和80%。

2、浮選法：通過分散的氣泡粘附廢水中的污染物從而達到液液或固液分離的一種處理方法。浮選物化法又叫氣浮法主要包括四大類:溶解空氣氣浮法、電解氣浮法、生物及化學氣浮以及分散空氣法。其中的化學氣浮法相比于其他幾種氣浮法夠在中藥廢水的處理中取得最為大量的運用。廢水采用化學氣浮法理后，對廢水中COD和懸浮物SS分別能夠達到不低于50%和79%的去除率。

3、混凝法：通過將凝聚劑加入污水中來降低有機物的濃度從而使污水的降解性能得到提高的一種處理方法。比較常用的混凝劑包括氯化鐵、PAC、聚合硫酸鐵、PAM以及聚合氯化硫酸鋁，混凝法能夠比較廣泛的應用在中藥廢水的治理中。

4、膜析法：通過天然或人工合成的膜使濃、稀溶液分隔開，在外界能量或壓力差作的作用下從而將高濃度一側的水壓滲到低溶度的一側，達到以污水濃縮和凈化為目的的一種處理方法。

5、濕式空氣氧化法在高溫高壓的情況下，通過空氣或純氧的氧化作用從而將大分子的復雜污染物分解成小分子的有機物或無機物的一種化學方法。在對中藥廢水進行處理時，濕式氧化系統COD能夠達到最高95%的去除率。

6、生物處理法：生物處理技術是一般有機廢水處理系統中最重要的過程之一，是利用微生物，主要是細菌的代謝作用，氧化、分解、吸附廢水中可溶性的有機物及部分不溶性有機物，并使其轉化為無害的穩定物質從而使水得到凈化的技術。在現代的生物技術理過程中，主要有好氧生物氧化、兼氧生物降解及厭氧消化降解被廣泛應用，生物處理技術由于經濟可行、無二次污染等特點，已越來越引起重視。

7、化學處理技術：化學處理技術是應用化學理和化學作用將廢水中的污染物成分轉化為無害物質，使廢水得到凈化的方法，其單元操作過程有中和、沉淀、氧化還原、催化氧化和焚燒等。